Durante este semestre he aprendido mucho acerca de la función del citocromo P450 y como mutaciones en sus diferentes regiones afecta el metabolismo de ciertas drogas terapéuticas. Además he aprendido muchas técnicas nuevas de laboratorio como extracción de ADN y PCR-RFLP. Lo mas importante de todo es que he desarrollado mucha paciencia y he puesto en practica mis conocimientos de genética. Las barreras y retos que he enfrentado en mi proyecto son problemas con la amplificación del gen y contaminación. He logrado superar este problema con ayuda de los miembros de mi laboratorio y con mucho “troubleshooting” para optimizar mis PCR. Mis expectativas para el semestre próximo son terminar de analizar las 500 muestras para CYP2C19*2 y *3 y comenzar a analizar otra región del citrocromo P450.
Visita a los blogs y técnicas aprendidas April 2, 2008
Tuve la oportunidad de visitar 3 blogs de estudiantes de la UPRM. La primera fue Agnes Acevedo la cual esta llevando a acabo uno de los pocos proyectos teóricos de Bio Minds. Ella utiliza el campo de la bioinformática para comparar y analizar secuencias funcionales de integrasas de ambientes extremos de las cuales buscando sitios conservativos para luego realizar PCR. La segunda fue Paloma Monroig la cual esta llevando a cabo un estudio de monitoreo de agua de plantas de tratamiento con el fin de ver si se encuentran en ellas genes casetes provenientes del ambiente hospitalario los cuales se podrían insertarse en los integrones de bacterias no-resistentes a antibióticos. El tercero fue Nelson González el cual investiga la relación que existe entre los compuestos PAH’s (Polycyclic Aromatic Hydrocarbons) y los daños que puede ocasionar en las cadenas de DNA ya que la mayoría son carcinógenos y pueden causar otros problemas a la salud.
Las técnicas que he aprendido durante mi proyecto de investigación son: extracción de ADN, PCR-RFLP, electroforesis y analizar la frecuencia de las variantes en la población. A mi entender lo más importante no es aprender a llevar a cabo las técnicas si no diseñarlas para obtener la información que deseas. Durante esta experiencia pude ver la calidad de el ADN extraído ya que cuantifique mis muestras, diseñar primers específicos para las regiones de interés, diseñar un programa optimo para llevara cabo el PCR, y enzimas de restricción que me permitieran ver si la variante mutante esta presente en una gel de agarosa. Además pude poner en práctica el conocimiento del equilibrio Hardy Weingber para los genes de CYP2C19 en la población de P.R.
